FileZillaでアップロードする際に、「open for write: permission denied」によりアップロードできませんでした。
FileZillaで接続したユーザーが、そのディレクトリにアクセスする権限がなかったからです。
そのため、そのディレクトリの所有者を一時的に接続ユーザーのものにして、このエラーを回避します。
業務で扱うサーバーであればあまりよろしくないかもしれませんが、個人サーバーなのでよしとします。
変更するディレクトリを指定し、以下のようにコマンドを実行すれば、ファイルをアップロードできるようになります。
$ sudo chown {接続先ユーザー}:{接続先ユーザー} {変更対象のディレクトリ}
アップロード完了後、元に戻します。
$ sudo chown {元のユーザー}:{元のユーザー} {変更対象のディレクトリ}